一直信奉“科学至上”的理工科男生张驰因为意外获得了看见妖怪的能力，并在情急之下为了救博物馆的妖怪搜捕员岳悦而觉醒了自己从未发觉过的力量——本来只想过普通生活的张驰，之后却机缘巧合下加入了博物馆，开始了收服妖怪的新生ccc。在张驰的身边逐渐围聚了一批性格各异，身份不同的伙伴们。在与妖怪打交道的过程中，博物馆的敌对组织搜神堂逐渐浮出水面，团队多次陷入困境，本来性格懦弱的张驰利用自己的独特力量以及科学的分析战斗方法帮助伙伴们转危为安，并逐渐成长为了可靠的团队领袖......